關(guān)鍵字:智能手機顯微鏡 醫療診斷 掃描DNA 電子實(shí)驗室模塊
這款智能手機的附件包括一個(gè)外部透鏡、薄膜干涉濾光器、可微調的微型楔形榫頭支架,以及雷射二極管,全部封裝在一個(gè)以3D打印的小型方盒中,并整合成一款手持式熒光顯微鏡。
“DNA單分子在拉長(cháng)時(shí)的寬度約2nm,”UCLA霍華德.休斯醫學(xué)院(HHMI)教授A(yíng)ydogan Ozcan表示,“以透視來(lái)看,它使DNA較人的發(fā)絲還細約50,000倍。目前,為單個(gè)DNA分子進(jìn)行成像需要昂貴又龐大的光學(xué)顯微鏡工具,使其幾乎僅限于先進(jìn)的實(shí)驗室設置才能進(jìn)行。相形之下,這款適用于個(gè)人手機的附件設備顯然就沒(méi)那么昂貴了。”
雖然其他“智能手機變身顯微鏡”的設備也能夠成像出較大規模的對象,例如細胞;但是,Ozcan的研究團隊最新開(kāi)發(fā)出的這款智能手機光學(xué)附件,則是首款可成像DNA單分子纖薄鏈以及調整其大小的設備。
該設備主要用于遠程的實(shí)驗室設置,以診斷不同類(lèi)型的癌癥與神經(jīng)系統疾病,例如阿爾茲海默癥(Alzheimer),以及偵測傳染病的抗藥性。為了利用手機上的相機,首先必須以熒光標記隔絕以及標示所需的DNA。Ozcan表示,如今,這種實(shí)驗室程序已經(jīng)能在偏遠地區以及資源有限的環(huán)境下進(jìn)行了。
為了掃描DNA,研究團隊開(kāi)發(fā)出可執行在同一支智能手機上的運算接口,以及一款Windows智能應用程序。掃描后的信息可被傳送至遠程O(píng)zcan實(shí)驗室中的服務(wù)器,然后測量DNA分子長(cháng)度。在聯(lián)機可靠可情況下,完整的數據處理過(guò)程只需要10秒鐘的時(shí)間。
圖中顯示智能手機安裝該成像設備與用戶(hù)接口,并以25美分硬幣作為對比。(來(lái)源:UCLA)
在Ozcan的實(shí)驗室中,研究人員們成像熒光標記與拉伸DNA節段,為該設備的準確度進(jìn)行測試。結果發(fā)現它能夠可靠地倍增10,000個(gè)堿基對或更長(cháng)的DNA節段(堿基對是構成DNA的基本結構單元)。許多重要的基因都落在這個(gè)大小范圍,包括為金黃色葡萄球菌與其他細菌提供抗生素抗藥性的細菌基因 ,大約有14,000個(gè)堿基對長(cháng)。
然而,由于較短節段時(shí)的訊噪比(SNR)偵測減少以及明顯差異,智能手機顯微鏡在5,000或更短堿基對節段時(shí)的準確度急速下降。這時(shí),必須將該設備的現有透鏡置換成更高數倍數,就可以輕易地解決這個(gè)問(wèn)題。
除了用于定點(diǎn)照護診斷,Ozcan建議該平臺也可用于區別高分子量的DNA節段,從而有助于解決使用傳統凝膠電泳的問(wèn)題——在生物化學(xué)和分子生物學(xué)中,這種凝膠電泳經(jīng)常用來(lái)擴展DNA與RNA節段。接下來(lái),Ozcan及其研究團隊計劃測試該領(lǐng)域的其他組件,進(jìn)一步偵測與瘧疾有關(guān)的抗藥性。
延伸閱讀:蘋(píng)果開(kāi)發(fā)應用收集用戶(hù)DNA數據
《麻省理工科技評論》報道稱(chēng),蘋(píng)果正在與美國多家研究機構合作開(kāi)發(fā)應用,收集并整理用戶(hù)的基因數據。
報道援引消息人士的說(shuō)法稱(chēng),這些應用將“向一些iPhone用戶(hù)提供機會(huì ),幫助他們進(jìn)行基因檢測”。其中,許多人將是首次進(jìn)行基因檢測。
這些新應用將基于蘋(píng)果的ResearchKit。這一數據整合平臺可以收集來(lái)自用戶(hù)設備的信息,將信息進(jìn)行打包用于醫學(xué)研究。醫院和其他研究人員可以連接至ResearchKit平臺,從而迅速獲得大量的研究樣本。
蘋(píng)果目前已發(fā)布了一些基于ResearchKit的應用。在幾天之內,這些應用就吸引了數千用戶(hù)。
蘋(píng)果的下一步計劃是收集用戶(hù)的基因數據。不過(guò),由于首先需要通過(guò)生物樣本去創(chuàng )建基因數據,因此蘋(píng)果將要求應用用戶(hù)提供唾液樣本。這些樣本不會(huì )被送往蘋(píng)果,而是被送往加州大學(xué)舊金山分?;蚣~約西奈山醫院的基因測序中心。研究人員將在ResearchKit的云計算平臺中保存這些數據,其中一些信息將直接出現在用戶(hù)的iPhone中。
在基因研究領(lǐng)域,蘋(píng)果和研究合作伙伴需要非常謹慎,避免獲取及展示基因信息的過(guò)程被視為一種“診斷”。2013年,基因科技公司23andMe由于這樣的問(wèn)題遭到了美國食品藥品管理局的禁令。
蘋(píng)果尚未對此消息做出回應。